Много лет назад Джейк Салли предал своих соратников и перешел на сторону нави, а для этого ему пришлось пожертвовать своим телом и переселиться в трехметровое инопланетное тело аватара. Но сейчас он уже совсем другой человек - благодаря новому облику и принадлежности к инопланетной расе, Джейк смог открыть для себя мир Пандоры и полюбить его таким, какой он есть.
Но не все смотрят на него благосклонно. Наемники "RDA" всегда готовы к нападению, и Джейк уверен, что однажды они обязательно вернутся. Но остальные жители Пандоры не воспринимают это серьезно и не готовятся к защите. Однако вскоре на планету прилетает несколько звездолетов с десантом, состоящим из жестоких людей, которые немедленно начинают разрушать местную природу и строить укрепленную базу.
Теперь Джейку приходится не только беречь свою семью и соотечественников, но и оставшихся на планете людей, среди которых есть подросток по прозвищу "Паук". Но дело не только в самообороне. Люди жаждут добычи ресурсов Пандоры, в том числе анаптаниума, который необходим для поддержания энергетики, а также жира китоподобных существ, который используется в медицине.
Однако не все из людей на Пандоре такие жестокие. Ученые "RDA" даже вернули смертельно раненого полковника Куоритча обратно к жизни, превратившегося после этого в опасного бойца с уникальными боевыми умениями. Он готов отомстить Джейку за то, что тот предал своих соратников. Но командиром "RDA" стала дама по имени Фрэнс Ардмор, которая предпочитает более мягкий подход к конфликтам.
Каждый из персонажей на Пандоре преследует свои цели - кому-то нужна месть, кому-то защита, а кто-то просто хочет выжить. И все они готовы пойти на крайние меры, чтобы достичь своих целей. Но только время покажет, кто окажется сильнее - люди или природа Пандоры.
